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冷泉港蛋白质组学实验手册
作者:(美)林克(Link,A. ),(美)拉巴厄(LaBaer,J. )著 出版社:化学工业出版社 出版日期:2012年06月 ISBN:978-7-122-14121-7 中图分类:Q51-33 ( 生物科学 > 生物化学 )
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书名页 版权页 翻译人员名单 出版者的话 前言 译者的话 目录页 简介 实验1 全细胞裂解物的双向凝胶电泳和MALDI质谱分析 操作程序1-1 酵母细胞裂解液的制备 操作程序1-2 IPG胶条的再水化和等电聚焦 操作程序1-3 等电聚焦胶条的平衡 操作程序1-4 第二向——SDS-PAGE 操作程序1-5 用SYPRO Ruby进行全蛋白染色 操作程序1-6 用Pro-Q Diamond进行磷酸化蛋白染色 操作程序1-7 用Pro-Q Emerald进行糖蛋白染色 操作程序1-8 用考马斯亮蓝进行全蛋白染色 操作程序1-9 用质谱兼容的银染进行全蛋白染色 操作程序1-10 2D胶的图像分析和蛋白质回收 操作程序1-11 胶内酶切 操作程序1-12 MALDI点靶 实验2 用于质谱分析的蛋白质复合物的纯化 操作程序2-1 培养并收集TAP标记的酵母细胞 操作程序2-2 为纯化TAP标记蛋白质复合物制备酵母细胞抽提物 操作程序2-3 第一步亲和富集——利用IgG亲和色谱从酵母抽提物中捕获TAP标记的蛋白质复合物 操作程序2-4 第二步亲和富集——TAP-标记的蛋白质复合物的钙调蛋白亲和色谱 操作程序2-5 与磁珠的结合 操作程序2-6 蛋白质复合物的亲和纯化 实验3 用MALDITOF/TOF串联质谱进行肽的定性和定量分析 操作程序3-1 实验描述 实验4 蛋白质复合物分析——高灵敏液相色谱与串联质谱联用 操作程序4-1 HPLC柱毛细管的制作 操作程序4-2 填装微毛细管FSC柱 操作程序4-3 微毛细管RP-HPLC与ESI-质谱联用 实验5 用IMAC和质谱分析磷酸化肽 操作程序5-1 制备IMAC样品 操作程序5-2 制备IMAC柱和反相捕获柱(前柱) 操作程序5-3 制备IMAC柱 操作程序5-4 样品处理 实验6 全细胞裂解物的多维蛋白质鉴定技术分析 操作程序6-1 使用多维蛋白质鉴定技术分析全细胞裂解物 实验7 全细胞提取物的定量质谱检测技术(iTRAQ) 操作程序7-1 从酵母细胞制备肽 操作程序7-2 以iTRAQ试剂标记肽 操作程序7-3 应用反向色谱柱提纯肽 操作程序7-4 多肽等电聚焦 实验8 串联质谱数据的分析及确认 操作程序8-1 使用Global Proteome Machine系统分析LC-MS/MS数据 操作程序8-2 使用ProteinPilot软件进行肽段和蛋白质鉴定 操作程序8-3 对数据库检索程序鉴定为能够匹配肽段序列的MS/MS谱图进行评价 实验9 开放阅读框的高通量克隆——构建大量表达结构 操作程序9-1 利用GatewayLR反应构造表达结构 操作程序9-2 用GatewayLR反应产物化学转化感受态细菌 实验10 蛋白质微阵列的构建——核酸可编程性蛋白质阵列 操作程序10-1 用氨基甲硅烷包被载玻片 操作程序10-2 在96孔板中制备细菌的培养物 操作程序10-3 从96孔板中分离质粒DNA 操作程序10-4 DNA的生物素化、沉淀及样品布阵 操作程序10-5 NAPPA载玻片上蛋白质的表达 操作程序10-6 检测NAPPA载玻片上的蛋白质 操作程序10-7 在NAPPA芯片上测定DNA 实验11 使用核酸可编程性蛋白质阵列鉴定蛋白质-蛋白质相互作用 操作程序11-1 NAPPA芯片与查询蛋白共表达 操作程序11-2 在NAPPA芯片上检测查询蛋白 附录1 钠升电喷雾电离离子源和串联质谱装置和示范 附录2 溶液内蛋白质的消化 附录3 凝胶内胰酶消化已分离蛋白 附录4 三氯乙酸蛋白质沉淀法 附录5 氨基酸的单同位素和亚铵离子分子量 附录6 氨基酸二肽分子量 附录7 LTQ离子阱的使用方法 附录8 肽段混合物离线去盐 附录9 感受态细胞的制备 附录10 DNA的定量 附录11 注意事项 索引 ..更多
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